1、利率的差别

余额宝的利率是跟随市场变化的，但是变化幅度不大，一般在3%-4%之间，和投资者是否购买无关，投资者购买后每天可以看到收益，收益每天都会有小小的变动。

国债逆回购的利率也是随着市场变化的，但是投资者一旦购买之后，国债逆回购的利率就固定了，无论市场上国债逆回购的利率如何变化，和您购买的国债逆回购无关了，因此购买过的国债逆回购就像银行定期存款一样。

国债逆回购的利率波动幅度在0-50%之间，因此国债逆回购和余额宝比有更灵活的套利空间。短期国债逆回购利率波动大，投资者要选高避低；90天以上的国债逆回购一般都会超过余额宝的收益，因此，稳健投资者可以选择90天以上的国债逆回购。

2、购买方式的差别

余额宝通过支付宝购买，可以利用银行卡直接付账，也可以把资金充入账户余额后购买，投资者可以每天交易，但是利率计算是采用交易日T+1的方式。余额宝支持随时赎回，提现基本即时到账。

国债逆回购则需要通过证券账户交易，必须先把资金充入证券账户，然后购买。投资者需在正常交易日内进行交易，利率计算按交易日T+0的方式。

国债逆回购到期后本息回到投资者的证券账户，不影响投资者当日进行股票交易，但是提现需要到下一工作日才行。