预计在股指期货推出初期，空头套期保值将是我国投资组合管理中居主导地位的运用形式。使用股指期货进行套期保值的风险主要来自于两个方面：基差风险和期货的保证金交易风险。

　　基差是指期货价格和现货价格之间的差额，受到未来市场预期、持有成本等多种因素的影响。在持有股指期货合约的期间，基差常常会受到上述因素影响而发生变化，导致期货和现货价格变动的不一致，影响套期保值的效果。由于期货价格和现货价格随着期货合约到期日的临近会趋于一致，因此在现货的持有期可以预先确定或合理估计的情况下，选择持有期结束次月（如果预计持有期在某月的月初结束，则选当月）的股指期货合约进行套期保值，可以有效降低基差风险。

　　保证金交易风险，是指期货价格的不利变动导致用于套期保值的期货持仓的保证金账户余额低于维持保证金的风险。如果此时投资组合中的现金持仓不足以提供所需的追加保证金，则部分期货头寸将被强行平仓以满足保证金要求，套期保值的效果也会因此大打折扣。反之，为了避免保证金交易风险而在组合中保留大量现金或其它高流动性、低收益的资产，又会对组合的整体表现产生不利影响。由于指数的收益率分布往往呈现厚尾效应（出现极端情况的概率比正态分布假设下高），因此比较稳妥的做法，是借鉴在银行业中得到广泛使用的VaR（在险价值）风险管理方法：利用一段较长时间的历史数据，计算指数波动出现极端情况的概率，以及此时组合中套期保值期货持仓所需追加的保证金规模，并据此估算组合中用于应对保证金交易风险的现金持仓的最佳比例。当市场环境出现显著变化时，需要调整这一比例以更好地管理风险。