股通和港股通都是通过一定的协议，让境外投资者能够购买内地上市股票，但两者还是有一些区别的。

不同的股票市场：沪股通指的是香港交易所与上海证券交易所之间的连接机制，而港股通则是深圳证券交易所与香港交易所之间的连接机制。

贸易制度与结算方式：沪股通采用“T+0”交易制度，即当日可申购当日可卖出；而港股通采取“T+1”交易制度，在购买后等待一个工作日才能卖出。另外，沪股通的结算货币是人民币，港股通的结算货币是港元。

投资入门门槛不同：沪股通需要个人或机构在香港开立A股证券账户并注资，同时满足中国相关法规的限制和具备足够的人民币/港元存款；而港股通需要个人或机构在香港开立恒生银行股份账户及沪深通指定席位券商证券账户，并完成相关业务审核手续。

可投资范围不同：沪股通允许香港和国际投资者通过连接买卖上海证券交易所的A股市场，包括大陆公司在内的近1000家公司的A股，而港股通则允许香港和国际投资者通过连接买卖深圳证券交易所的A股市场以及香港交易所的H股、红筹股等。