期货基差风险主要涉及以下几个方面：

1. **基差波动风险**：基差是现货价格与期货价格之间的差额，其变化方向和幅度可能与预期不同，导致套期保值效果与预期出现偏差。基差的不确定性使得套期保值者面临基差风险，这种风险在期货合约到期时可能会影响套期保值的效果。

2. **交割品错配风险**：期货合约的交割品可能与现货市场上需要对冲的商品不完全一致，这种错配可能导致基差风险。例如，如果期货合约的交割品是某种标准化的商品，而现货市场的商品可能有不同的规格或品质，这可能导致基差变动的不确定性。

3. **流动性风险**：基差交易可能涉及的现货或期货合约流动性不足，导致难以在理想价格上进行买卖，从而影响套期保值的效果。

4. **价格风险**：基差交易需要在国债期货和国债现货上同时进行操作，由于现货市场上价格的不连续性，可能会出现看到价格但无法交易到的情况，导致实际成交价格与预期存在差异。

5. **数值舍入风险**：在进行基差交易时，期货和现货的数量比例需要进行四舍五入，这种操作可能导致实际交易比例与理论比例存在偏差，从而产生风险。

6. **期现数量调整风险**：在交割环节，可能需要对期货现货数量进行调整，这种调整会增加额外的交易成本，并可能对最终绩效产生影响。

7. **国债回购风险**：在现货交易中使用国债正回购操作可以减少资金需求，但同时增加了新的风险，包括操作风险和价格变动风险。

8. **做空基差风险**：做空基差交易比做多基差交易面临更多风险，因为国内现货做空渠道较少，且可能存在违约风险。

9. **收益率风险**：基差交易需要对市场的收益率水平进行准确判断，判断错误可能导致亏损。

10. **资金成本的波动风险**：资金成本的变动会影响持有收益，从而影响基差交易的损益。

11. **资金成本的计算风险**：不同交易者的资金成本不同，导致计算的持有收益和交易机会存在个性化差异。

12. **展期优化和仓位管理风险**：在进行空头对冲与多头替代中的基差管理策略时，需要通过展期优化和仓位管理来应对基差变化的风险。

为了管理这些风险，套期保值者需要密切关注基差的变化，合理选择期货合约，确保交割品与现货商品的一致性，并采取适当的风险管理措施。同时，了解和应用基差贸易的原理，合理分配利润，增强商品流动性，促进销售与采购。此外，采用展期优化和仓位管理策略，以及加强对风险的实时监控和严格的交易与风险限额，都是管理基差风险的有效手段。