交易时间不同之处
港股通：交易日9：00至9：30为开市前时段，投资者只能输入“竞价限价盘”委托指令。9：30至12：00是早市，13：00至16：00是午市，这两个时段投资者只能输入“增强限价盘”指令。16：00至16：10为收市竞价交易时段，投资者只能输入“竞价限价盘”委托指令。若为半日市，收市竞价交易时段会调整为12：00至12：10。
A股：开盘集合竞价时段为9：15至9：25，连续竞价时段是9：30至11：30和13：00至14：57，收盘集合竞价时段为14：57至15：00。相比之下，港股通交易时间比A股长一个半小时左右，A股收盘后，港股通仍可交易。
节假日安排

港股通：由于香港和内地的公众假期安排不同，有些A股的交易日并不能进行港股通交易。例如，香港市场在圣诞节前夕、新年前夕和农历新年前夕这三天若为交易日，则仅有半天交易，相应的港股通交易也仅有半天。另外，在一些特殊的恶劣天气如香港当天遇到八号或以上台风或者黑色暴雨警告，港股通交易时间也会按照警告信号发出时间做出相应调整。
A股：2025年元旦1月1日休市，1月2日起照常开市；春节1月28日至2月4日休市，2月5日起照常开市；清明节4月4日至4月6日休市，4月7日起照常开市；劳动节5月1日至5月5日休市，5月6日起照常开市；端午节5月31日至6月2日休市，6月3日起照常开市；国庆节、中秋节10月1日至10月8日休市，10月9日起照常开市。