对于同一只新股，融资融券账户和普通账户不能分别申购。根据规定，投资者参与网上公开发行股票的申购，只能使用一个证券账户。融资融券客户信用担保账户可以直接申购新股，但同一投资者使用多个证券账户参与同一只新股申购的，以及投资者使用同一证券账户多次参与同一只新股申购的，以该投资者的第一笔申购为有效申购，其余申购均为无效申购。这意味着，如果投资者在普通账户申购了新股，就不能再在融资融券账户申购同一只新股，反之亦然。因此，投资者需要注意，不能在两个账户中分别对同一只新股进行申购。

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