通过港股通进行交易时，投资者需要支付以下费用：

1. **印花税**：按成交金额的0.1%双边收取，不足1港元按1港元收取 。

2. **交易征费**：证监会交易征费为成交金额的0.0027%双边收取，四舍五入至小数点后两位 。

3. **交易费**：联交所交易费为成交金额的0.00565%双边收取，四舍五入至小数点后两位 。

4. **会财局交易征费**：会计及财务汇报局交易征费为成交金额的0.00015%双边收取，四舍五入至小数点后两位 。

5. **结算费**：包括股份交收费和证券组合费。股份交收费为成交金额的0.002%双边收取，每边最低及最高收费分别为2港元及100港元 。

6. **佣金**：港股通交易佣金不高于成交金额的3.0‰，具体佣金由各券商营业部自主设定，一般为万分之2.5双边收取 。

7. **交易系统使用费**：每笔交易0.5港币，部分成交按成交笔数分别计算 。

8. **证券组合费**：根据持有港股的市值设定不同的费率，详见国泰君安官方网站的收费公示 。

投资者在进行港股通交易时，应考虑这些费用对投资成本的影响，并及时与所在营业部协商具体佣金设置。