国元证券股票开户低佣金的流程主要包括以下几个步骤：

在线联系国元证券的客户经理，获取在线证券开户二维码。使用手机扫描二维码，下载并打开国元证券的开户软件。在软件中输入手机号获取验证码，进入开户页面。录入并完善个人基本资料，上传身份证正反面照片。确保照片清晰，四个角都要拍进去，并且地址要精确到门牌号。根据页面提示，选择想要开通的股东账户，并签署相关协议。进行视频认证。在此过程中，需要如实回答问题，以核实个人信息。选择三方存管银行，并绑定一张常用的银行卡。确保银行卡状态正常，并且银行卡号和密码输入正确。设置6位数字的交易密码和资金密码。请务必牢记这两个密码，以便日后进行交易操作。完成风险测评问卷，以评估个人的风险承受能力。最后，提交开户流程审核。等待开户结果，如果资金账号出来表示开户成功。

需要注意的是，以上流程可能因国元证券的更新而发生变化，具体以当时页面提示为准。此外，在开户前，建议与客户经理充分沟通，了解低佣金的具体政策和要求。同时，在开户过程中，也需要注意保护个人信息安全，确保在官方渠道进行开户操作，并遵守相关交易规则。

最后，需要强调的是，低佣金开户并不意味着可以忽略其他因素。在选择券商和开户时，还需要综合考虑公司的实力、信誉、服务质量、投资研究能力等多方面因素。这样才能确保获得更好的投资体验和回报。