1、比门槛：场内货币基金更亲民
作为现金管理工具，从参与门槛来看，逆回购作为相对货币基金的门槛较高，上交所逆回购的参与门槛是10万元起投，深交所是1000元起投。而货币ETF二级市场参与门槛多数是1万，一级市场在1000或者100，如南方理财金H是100元起投，相比之下，场内货币基金更亲民。
2、比期限：场内货币基金更灵活
投资期限来讲，逆回购有1天、2天、3天、4天、7天、14天、28天、91天、182天9个品种，隔夜回购成交最活跃，其次为7日逆回购。而目前主流的场内货币基金，如南方理财金H均享受日内“T+0”回转交易，投资者当日买入的基金份额，当日可以立刻卖出，且可以无限次重复买卖基金份额，日内回转交易可以确保投资者在享受基金收益的同时，不会错过任何交易机会。相比之下，场内货币基金的灵活度更高，在持有期限上也更为多变。
3、比收益：场内货币基金更稳定
收益能力方面，长期来看基本上场内货币基金收益要高于逆回购收益。此外两点半以后正回购的融资需求会大幅减少，因此两点半以后逆回购基本都会跳水，且两点半前逆回购一旦成交后资金当日无法再度利用，场内货币基金则享受日内“T+0”回转交易，买入即可计息，卖出资金即可使用。另外，每逢周末或者节假日，交易所休市，若在周五进行逆回购，则周六周日没有收益。而货币基金则不一样，周五买入，周六周日也能享受收益，因此场内货币基金成为了投资者的假期理财首选。
4、比风险：两者基本持平
一般来说，国债逆回购非常安全，只要逆回购收益大于交易手续费都不会亏损。而货币基金的投资方向主要包括现金，通知存款，短期融资券(包括超级短期融资券)，一年以内(含一年)的银行定期存款、大额存单等银行存款，剩余期限在397天以内(含397天)的债券、中期票据以及资产支持证券，期限在一年以内(含一年)的债券回购和中央银行票据以及中国证监会、中国人民银行认可的其他具有良好流动性的货币市场工具，这使得货币基金的运作风险也非常低，具有极高的安全性。