交易性质不同。北交所即北京证券交易所有限责任公司，是全国中小企业股份转让系统有限责任公司的全资子公司，是经国务院批准设立的中国第一家公司制证券交易所，是一个股票交易场所。新三板是指全国中小企业股份转让系统，简称全国股份转让系统，是区别于“一板”主板市场和“二板”创业板市场的概念，是对公司性质的定性。

交易场所不同。北交所是北京证券交易所，是一个场内交易市场。新三板是全国中小企业股份转让系统，在全国各地中小型企业股权融资的交易服务平台交易，是一个场外交易市场。

交易门槛不同。北交所个人投资者准入门槛为开通交易权限前20个交易日日均证券资产50万元，同时具备2年以上证券投资经验;机构投资者准入不设置资金门槛。新三板创新层的开业条件：两年以上股票交易经验，风险承受能力C4以上，前10个交易日日均资产不能低于100万;新三板基础层开户条件：要有两年股票交易经验，风险承受能力C4以上，前10个交易日日均资产不能低于200万。

交易规则不同。北交所新股上市首日无涨跌幅限制，设有临时性股票停牌机制，第二个交易日起，新上市股票的涨跌幅限制为30%。单笔申报100股起，可按1股为单位递增;卖出时，不足100股的部分应一次性卖出。竞价交易单笔申报最大数量不超过100万股。新三板创新层涨跌幅限制为50%，新三板基础层涨跌幅限制为100%。交易委托的股份数量以“股”为单位，新三板交易规则每笔委托的股份数量应不低于3万股，但账户中某一股份余额不足3万股时可一次性报价卖出。

上市对象不同。北交所交易的是“专精特新”概念股，是上市公司股票。首批在北交所上市的公司如果满足在精选层挂牌上市满1年以上，市值、财务指标、公众持股比例均要符合相应的要求，也可以向北交所提出上市申请。新三板指的是全国性的非上市股份有限公司股权交易平台，主要针对的是创新创业的中小微型企业，是代理转让的股票，不是上市公司股票。

上述是有关北交所和新三板之间的五点主要区别，大家可以关注一下。