国债逆回购亏损的原因主要有以下几个方面：

1、利率风险：国债逆回购的收益与利率相关。如果您在购买国债逆回购时的利率高于回购时的利率，您可能会获得收益。然而，如果回购时的利率高于购买时的利率，您可能会面临亏损。这是因为国债逆回购的回购利率是固定的，而市场利率可能会波动，导致亏损。

2、价格风险：国债逆回购的价格与国债的价格有关。如果国债价格下跌，回购时的价格将较低，可能导致亏损。

3、流动性风险：国债逆回购的交易可能面临流动性风险。如果在回购期间需要提前卖出或者赎回国债，可能会受到市场流动性不足的影响，导致亏损或者无法按时回购。

关于手续费，不同的平台和金融机构可能有不同的费率。一般来说，传统券商的手续费可能相对较高，而第三方支付平台或互联网券商的手续费可能较低。您可以通过与不同平台和金融机构进行比较，了解其收费标准和费率表，以选择手续费较低的平台。

需要注意的是，手续费并不是唯一的考量因素。您还应考虑平台的可靠性、交易功能、服务质量等因素来做出综合判断。在选择平台时，建议您综合考虑手续费以及其他因素，选择最适合自己需求的平台进行国债逆回购交易。