还是有一些差异的。
1、选股标准不同

红筹股指数成份股选取标准是：内地国有机构、省市单位直接或间接持有该红筹股不少于三成半权益。在联交所上市满12个月。被内地国有机构、省市单位或有关机构收购满12个月。在过去一年内，除非公司停牌交易，否则不可超过20个交易日无成交。不是国企H股。

国企指数以所有在联交所上市的中国H股公司股票为成份股计算得出加权平均股价指数。设立恒生中国企业指数的目的，是要为投资者提供一个反映在香港上市的中国H股企业的股价表现的指标。

2、法律约束不同

国企指数就是H股，红筹股有叫中资股，两者区别在于，国企指数是内地注册总部在内地的主要收内地相关法律约束，如税收，会计准则等，红筹指数是最先在香港注册并首此发行股票，主要要按香港的特别区法来约束公司，公司自理一般是按照香港惯例管理。

3、内容不同

港股的红筹指数与国企指数的差别在于恒生指数品种繁多，但其中影响较大的只有恒生成分指数、恒生中国企业指数，以及恒生香港中资企业指数（简称红筹股指数）三种指数。

由香港恒生银行全资附属的恒生指数服务有限公司编制，是以香港股票市场中的33家上市股票为成分股样本，以其发行量为权数的加权平均股价指数，是反映香港股市价幅趋势最有影响的一种股价指数。

红筹指数与国企指数的计算公式相同，恒生红筹股指数的计算公式为：

现时指数=（现时成份股的总市值）/（上日收市时成份股的总市值）*上日收市指数