现行有效的新三板股权激励管理类文件，以证监会和全国中小企业股份转让系统（以下简称股转系统）的两类为主，是目前合规开展相关业务的直接依据。
证监会2023年修订发布的《非上市公众公司监督管理办法》，作为上位配套的部门规章，明确了股权激励的基本框架，比如激励对象范围不包括持股比例过高的股东及其关联人等底线要求，允许挂牌公司采用限制性股票、股票期权等多种方式，简化了部分审议程序但强调了信息披露的合规性。
股转系统2021年发布的《全国中小企业股份转让系统股权激励业务指引》，是更具体的操作规范，细化了不同激励方式的行权要求、股份来源、授予价格定价参考区间等细节，还针对基础层、创新层、北交所平移层的不同挂牌公司，做了差异化的披露和监管安排。
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