新三板即全国中小企业股份转让系统，是经国务院批准设立的全国性证券交易场所，主要为创新型、创业型、成长型中小微企业发展服务 。与主板、创业板、科创板的区别主要体现在以下方面：​

服务对象：主板主要服务大型优秀企业，多为行业龙头；创业板服务成长型创新创业企业；科创板聚焦符合国家战略、突破关键核心技术、市场认可度高的科技创新企业；新三板则面向数量众多、处于初创或成长早期的中小微企业。​

上市条件：主板上市条件最为严格，对企业的盈利规模、资产规模、股本总额等要求较高；创业板上市条件次之，但也对企业的盈利、市值等有明确规定；科创板重点关注企业的研发投入、创新能力，设置了多套市值与财务指标组合的上市标准；新三板挂牌条件相对宽松，不设盈利要求，更注重企业的合法合规经营和持续经营能力。​

交易制度：主板和创业板主要采用竞价交易制度；科创板除竞价交易外，还引入了盘后固定价格交易；新三板交易方式多样，不同层级交易方式有差异，基础层主要采用集合竞价和做市交易，创新层和北交所（新三板精选层升级而来）可采用竞价交易、做市交易和盘后固定价格交易等。

​投资者门槛：主板和创业板投资者门槛较低；科创板要求投资者具备一定的资产规模和投资经验；新三板投资者门槛相对较高，不同层级也有不同要求，例如个人投资者参与创新层交易，需具备 100 万元金融资产，参与基础层交易则需 200 万元金融资产 。