北交所与科创板在新股申购方面的配售原则有显著的区别：

北交所采用的是比例配售加时间优先的原则。如果网上申购的数量超过发行量，配售会按比例进行。具体来说，投资者的获配数量是根据发行量与有效申购总量的比例来确定。不足100股的部分会汇总，之后根据申购数量优先、数量相同则时间优先的原则，按照时间顺序配售。北交所的申购不需要市值，只需全额缴款。因此，申购数量越多、下单越早，获配的机会就越大。

科创板采用的是市值配售加摇号抽签的方式。投资者需要持有一定数量的沪市非限售A股市值，每5000元市值可以申购500股。申购完成后，通过摇号抽签来确定中签号，中签者才获配股票。这意味着科创板更为倾向于与投资者持有的市值相关，中签概率与市值挂钩，并且资金只在中签后需缴款，冻结时间相对较短。

总结而言，北交所的申购机制更强调资金投入量和时间优先性，适合那些资金充裕且愿意承担资金冻结风险的投资者；而科创板则依赖市值和中签概率，更适合管理市值的投资者。