在更换证券账户的第三方银行存管时，通常并不需要将所有资金全部转出。然而，具体操作步骤和要求可能会因不同的证券公司和银行而有所不同。一般情况下，以下是常见的步骤：

预约或咨询：您需要先联系您的证券公司，了解更换银行存管的具体流程和要求。可以通过客服电话、官网或手机应用查询相关信息。

账户余额：一般情况下，账户中有资金余额时，需要将这些资金转出到原有的银行账户，确保账户余额为0。

基金持仓：如果您已经购买了基金或其他理财产品，通常不需要卖出这些产品。但为了确保流程顺利，建议提前咨询证券公司是否有特殊要求。

提交申请：按照证券公司的指引，提交更换银行存管的申请。通常需要提供新的银行账户信息和相关资料。

确认和审核：证券公司会对您的申请进行审核，审核通过后会通知您更换完成。新银行账户将成为您的资金存管账户。

总之，具体流程可能会有所不同，建议您直接联系您的证券公司进行详细咨询，以确保操作的正确性和顺利性。