选择佣金低的证券账户并不一定意味着存在安全隐患，但确实需要注意以下几个方面，以确保自己的投资安全：

选择正规券商：确保所选择的证券公司是经过中国证监会批准的正规公司。可以通过查询证监会官网或证券公司官网来确认其合法性。

券商评级：参考证监会发布的证券公司分类监管规定，选择评级较高的证券公司。评级较高的公司通常在风险管理、合规性和客户服务方面表现更好。

资金安全：正规的证券公司会将客户资金与公司自有资金分开管理，确保客户资金的安全。开立账户时，可以了解券商的资金管理制度。

交易系统稳定性：低佣金可能意味着券商在其他方面的投入较少，交易系统的稳定性可能受到影响。可以通过查阅用户评价或咨询其他投资者，了解券商交易系统的可靠性。

客户服务质量：低佣金可能意味着客户服务水平会有所下降。在选择券商时，可以通过试用其客服热线或在线客服，体验其服务质量。

隐性费用：有些低佣金的券商可能会通过其他隐性费用来弥补佣金的不足。

总之，选择佣金低的证券账户时，要综合考虑券商的正规性、评级、资金安全、交易系统稳定性和客户服务质量等因素。只要选择正规且信誉良好的券商，通常不会有太大的安全隐患。