在舟山市，网上开户和线下营业部开户主要有以下几个区别：

便捷性：

网上开户：只需准备身份证、银行卡和一部联网的手机，整个过程可以在家中或任何有网络的地方完成，一般只需十分钟左右，非常方便快捷。线下营业部开户：需要亲自前往券商的营业部，办理时间受营业时间限制，可能需要排队等候，相对来说比较费时费力。

开户费用和佣金：

网上开户：通常可以通过与客户经理联系，协商获得较低的佣金费率，最低可以达到成本价全佣。如果直接在券商APP上开户，可能会得到默认的较高费率（如万分之2.5）。线下营业部开户：同样可以与客户经理协商佣金费率，但由于需要亲自前往，有时可能不如网上开户方便。

服务和体验：

网上开户：主要依靠在线客服和电话支持，适合熟悉互联网操作且希望快速开户的人群。线下营业部开户：可以面对面得到客户经理的指导和服务，更适合需要更多咨询和面对面解答疑惑的人群。

安全性：

网上开户：需要确保网络安全，选择正规的券商APP，避免使用公共网络以防信息泄露。线下营业部开户：在营业部由工作人员核对资料，相对来说可能让人感到更有保障。

总的来说，选择哪种方式开户，可以根据自身的需求和偏好来决定。如果追求便捷和低费率，网上开户是一个不错的选择；如果希望得到更多的面对面服务和指导，线下营业部开户可能更适合。