北交所新股申购和沪深新股申购在参与条件和申购单位上有所不同。具体如下：

参与条件不同:

北交所新股申购：只需开通北交所交易权限，并且账户上有相应的资金即可申购新股，不需要市值要求。
沪深新股申购：需要满足市值要求。具体来说，投资者需在T-2日前20个交易日的日均持有市值在1万元以上。除此之外：
创业板（深市）新股申购：必须开通创业板权限，条件包括：申请开通权限前20个交易日证券及资金账户日均资产不低于10万元（不包括融资融券融入的资金和证券），并且有两年及以上的股票交易经验。
科创板（沪市）新股申购：必须开通科创板权限，条件包括：申请开通权限前20个交易日证券及资金账户日均资产不低于50万元（不包括融资融券融入的资金和证券），并且有两年及以上的股票交易经验。
申购单位不同:

北交所新股申购：申购单位为100股或其整数倍。
沪深新股申购：一般申购单位为500股或其整数倍。
总体来说，北交所新股申购的门槛相对较低，只需开通交易权限并且有足够资金即可参与，而沪深新股申购则需要满足一定的市值要求，并且创业板和科创板还需要满足特定的资产和交易经验要求。