南京证券公司的佣金一般为万分之三左右（0.03%）。这意味着，当您通过南京证券进行交易时，每笔交易的佣金是交易金额的万分之三。例如，如果您买入或卖出10万元的股票，那么南京证券将收取3元作为佣金。

需要注意的是，南京证券的佣金收费标准可能会根据不同的证券品种和交易方式进行调整。例如，股票交易、ETF交易和债券交易等可能有不同的佣金费率。此外，对于资金量较大或交易频繁的客户，南京证券也可能会提供更加优惠的佣金政策。

单笔交易的最低佣金费用为5元。也就是说，即使按照万分之三的佣金费率计算出来的佣金低于5元，南京证券也会按照5元收取最低佣金。

如果您希望获得更低的佣金费率，可以考虑以下几种方法：
1. 联系客户经理：在开户之前，可以联系南京证券的客户经理，协商更优惠的佣金费率。
2. 在线开户：通过南京证券的官方网站或移动应用程序进行在线开户，有时可以获得更低的佣金。
3. 资金量和交易频率：如果您有较大的资金量或者预计会有较高的交易频率，可以与南京证券协商获得个性化的佣金费率。

上面所述就是我对您南京证券公司的佣金一般是多少做出的回答，希望对您有所帮助，如果您还是有什么不懂的地方也可以右上角来添加我的微信或者致电给我，这边提供低佣金的优惠和1对1的专业服务，祝您投资顺利。