证券公司的佣金费用通常由以下几个方面计算：

交易佣金：交易佣金是指在买入或卖出股票时，所支付给券商的费用。通常以成交金额的一定比例计算，比如千分之几或万分之几。具体的佣金比例会根据券商的政策而有所不同，最高不超过成交金额的3‰。同时，券商还会设定一个最低佣金费用，如5元起。

过户费：过户费是指在进行股票转让时，需要支付给证券交易所的费用。过户费通常以每股一定金额计算，具体金额由证券交易所规定。

印花税：印花税是指在进行股票买卖时，购买方和销售方需支付给国家的税费。印花税的税率为成交金额的千分之一。

证券监管费：证券监管费是指在进行股票交易时，支付给证券监管机构的费用。证券监管费通常以成交金额的一定比例计算，比如千分之几。

一般来说，交易佣金是买卖股票金额的0.1%-0.3%，网上交易佣金较低，营业部交易佣金较高。每笔最低佣金为5元，印花税是卖出股票金额的0.1%（基金、权证免税），上海每千股股票要1元过户手续费（基金、权证免过户费），不足千股按千股算。