证券公司在股票交易中扮演着重要的中介角色，它们为投资者提供交易平台和相关服务，并相应地收取一定的手续费。具体分析如下：

佣金：这是证券公司向投资者收取的主要费用，根据交易金额的一定比例来计算。佣金的比例通常在0.03%至0.001%之间，具体比例可以通过与证券公司协商确定。大多数证券公司能提供万分之2.5的最低佣金率，且佣金不足5元时按5元收取。

印花税：这是一种国家税收，仅在股票卖出时征收，税率为交易金额的0.1%。买入股票时不收取此税项。

过户费：这是上海证券交易所独有的费用，按照成交金额的万分之二（0.002%）收取，双向收费。深圳证券交易所则不收取此项费用。

规费：包括征管费和经手费，这些费用通常包含在佣金中，不再单独向投资者收取。

为了降低交易成本，投资者在开户时应与客户经理协商，争取获得较低的佣金费率。此外，了解各种费用的构成和收费标准对于投资者合理规划交易策略、控制交易成本非常重要。

总的来说，证券公司手续费的收取涉及多个方面，包括佣金、印花税、过户费等，其中佣金是唯一可以根据投资者与证券公司的协商而有所变动的费用。投资者在选择证券公司和服务时，应综合考虑费用标准、服务质量、交易便利性等因素，以实现成本与服务的最优平衡。