要在线上办理股票交易并申请佣金较低的证券账户，可以按照以下步骤进行：

选择知名且级别高的证券公司。知名且级别高的证券公司通常资金实力雄厚、员工素质高、服务质量好、交易速度快、数据安全有保障，能够为投资者提供更加便利和高效的服务。

联系线上客户经理。线上客户经理可以帮助您制定低佣金方案，并协助您开户。他们通常会根据客户的资金量、交易频率等因素来制定不同的佣金方案，以尽可能降低您的交易成本。

下载并打开证券公司的交易软件，输入手机号和验证码登录。拍摄身份证正反面照片并上传，完善个人资料并进行系统风险评估。

绑定本人银行卡并开通交易资金的三方存管，确保资金安全。根据提示进行视频验证，确认是本人申请开户。等待工作人员进行电话回访，确认您的开户申请信息并回答您的问题。

需要注意的是，为了降低佣金费用，您可以提前联系线上客户经理，以便他们能够为您提供低佣金的方案。此外，在开户过程中，您需要提供真实的身份证明和银行账户信息，并仔细阅读相关协议和风险提示，确保您了解自己的交易风险并合法合规地进行股票交易。