ETF基金的风险主要包括标的指数的系统风险、无法超越指数表现、跟踪误差风险、无法任意更换投资组合、无法享有直接的股东权力等方面，具体的情况可以参考下面的内容。

1、标的指数的系统风险

根据投资组合理论，投资一档股票的风险包括市场风险和个别企业风险，总体经济因素所带来的市场风险却无法通过分散投资来予以消弭。ETF是一个投资指数的工具，所谓的系统风险就是大盘涨跌的风险，一旦下跌的话，投资人就会面临损失，这是必然的。但投资人应具备这样一个观念：适当地承担大盘下跌地风险，才有机会获取指数上涨的利益。

2、无法超越指数表现

目前在金融市场中，指数化的投资方式已被认为是成熟的且是成功的。整体而言，这种准备追随指数的投资方式，最大的缺点就是在牛市期间，ETF的投资只能紧贴市场，而难有超越大盘的表现，而在熊市期间，ETF也会随指数下跌。此外，由于ETF的买卖如股票一样，都要收取手续费，原本相对低廉的手续费，若买卖过于频繁，反而会变成相对较高的手续费。