投资者如要参与股份转让交易，必须开立专门的“非上市公司股份转让账户”。开户时需要携带本人身份证及复印件，到具有代办转让业务资格的证券公司营业网点开立帐户，并与证券公司签订股份转让委托协议书。开户费用为人民币３０元。如果已退市公司的投资者要进入代办股份转让系统转让股份，也需要开立“非上市股份公司股份转让帐户”，并将退市公司股份转托管到所开立的专门帐户后才能进行交易。
三板市场的交易规则是，股份转让以“手”为单位，一手为１００股。申报买入股份，数量应当为一手的整数倍。不足一手的股份，只能一次性申报卖出。同时，股份转让价格实行涨跌幅限制，涨跌幅比例限制为前一转让日转让价格的５％。投资者委托股份转让和非转让过户（挂失除外），要交纳印花税和手续费。转让日申报时间内接受的所有转让申报采用一次性集中竞价方式配对成交