阿里巴巴的双层股份结构指的是公司在上市时设立了两类股票：普通股和特殊股（一般是B股）。普通股通常由创始人和核心管理层持有，而特殊股则由普通股以外的投资者持有。这种结构在一些公司中常见，旨在保护公司创始人和核心管理层的控制权和决策权。

以下是双层股份结构的一些利弊：

利：

1、维护创始人和核心管理层的控制权：双层股份结构使创始人和核心管理层能够通过持有普通股来保持对公司的控制权和决策权，即使他们只持有相对较小的股份。这种结构可以帮助创始人保持对公司的战略方向和发展决策的影响力。

2、长期战略规划和稳定性：创始人和核心管理层通常对公司有较深入的了解，并且对公司的长期战略规划和稳定性有更强的关注。他们可以在决策中考虑长期利益，而不仅仅是短期股东利益。

弊：

1、股东权益不平等：双层股份结构可能导致不同类型股东之间的权益不平等。普通股持有人的投票权和决策权相对较弱，特殊股持有人则具有更大的影响力。这可能引发股东之间的不满和争议。

2、股东代表权的缺失：由于普通股股东的权益相对较弱，他们可能无法有效地参与公司决策和监督。这可能导致公司治理问题和潜在的利益冲突。

3、投资者保护问题：双层股份结构可能对普通股投资者的权益保护带来挑战。特殊股持有人在公司决策中占据主导地位，而普通股投资者的利益可能会受到忽视。

需要注意的是，双层股份结构的利弊因公司和市场而异。某些投资者可能更愿意接受这种结构，因为他们相信创始人和核心管理层的决策能力和长期愿景。然而，对于其他投资者来说，这种结构可能会引发担忧和风险。

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