港股通的交易费用包含佣金、股票印花税、交易徵费、交易费、中央结算收费。
1、佣金：每宗交易金额的0.25%，支付予证券公司
2、股票印花税：每宗交易金额的0.1%，支付予香港政府
3、交易徵费：每宗交易金额的0.003%，支付予证监会
4、交易费：每宗交易金额的0.005%，支付予交易所
5、中央结算收费：每宗交易金额的0.002%，支付予结算所(最低港币2元,最高港币100元)
港股实行T+0回转交易、T+2交收制度，但深港通分为港股通和深股通两部分，投资者当日买入的港股通港股股票，经确认成交后，在交收前即可卖出，即港股通也支持T+0交易，但通过深股通买入的A股股票，在交收前不得卖出，即不支持T+0交易。
港股通股票交易以港币报价，以人民币作为支付货币。
港股通交易日和交易时间由沪深交易所证券交易服务公司在其指定网站公布。