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同花顺在证券公司办理低佣金操作流程如下：
第一步，在线联系券商客户经理，咨询好开户前的注意事项。
第二步，准备好本人身份证和银行卡直接手机点击注册就可以了。
第三步：在线注册，提交个人的身份资料，开设相应的股东账户卡。
第四步，填写开户申请书，签署《证券交易委托代理协议书》，开设资金账户。
第五步，完成相关的协议，需填写《网上委托协议书》，并签署《风险揭示书》。
第六步，办理资金的第三方存管。

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