理论上菜粕的用途包括用作饲料蛋白原料、生产菜籽蛋白和提取化工原料，但实际上，我国的菜粕基本全部用作饲料蛋白原料。

菜粕作为一种重要的饲料蛋白原料，和其他蛋白原料相比，具有某些特性。首先，和豆粕相比，粗蛋白含量低于豆粕，但价格便宜，一般菜粕/豆粕比价在80%以下时，在水产料中添加菜粕具有价格优势。其次，菜粕中粗纤维含量-般在10-14%，含量较高，加上8%左右的不易消化的戊聚糖，可利用能量水平低于豆粕和花生粕，但高于棉粕。第三，菜粕中含有硫甙、植酸、单宁、介子碱、皂素等抗营养因子，一般情况下，只要适当控制添加量就可以不进行脱毒处理。

菜粕在水产料、禽料、猪料中都可以添加使用，但是在实际应用的添加比例主要考虑和豆粕等其他蛋白原料的价差以及如何克服菜粕添加在各种饲料中的技术问题。近几年由于豆菜粕价差持续保持在低于历史平均的水平，菜粕主要应用在水产饲料中。