近日，由浙江大学棉花精准育种团队、中国农科院生物技术所和湖畔实验室(阿里巴巴达摩院)智慧育种团队组成的联合科研团队，综合运用遗传学、生物大数据和AI技术，构建了涵盖207个品种的棉花全基因组DNA甲基化图谱，鉴定2.87亿个单甲基化多态性(SMP)位点，规模为目前所有作物之最。

　　联合团队从中发现43个潜在参与纤维发育的eQTM基因，为棉花育种提供重要的候选基因列表。相关论文发表在国际顶级期刊《细胞研究》(CellResearch)上。

　　群体单碱基DNA甲基化多态性的精准鉴定、调控网络解析与预测模型构建

　　棉花是全球最大的天然纺织纤维来源，需要通过不断聚合优异的基因组遗传位点，进行品种改良。在AI、大数据等技术加持下，农业正在步入“智慧育种”时代，通过综合作物基因型数据、表型数据和环境数据，预测作物性状，精准筛选出优异基因。

　　湖畔实验室融合AI、并行计算等技术开发了一套新型算法，加速海量遗传数据的分析处理。湖畔实验室智慧育种团队负责人顾斐表示：“相比起传统方法，AI加成的分析计算速度提升近100倍，有助于开展亿级序列对比、群体变异分析和多组学关联分析，在数百个遗传变异、数万个基因以及数亿个甲基化位点之间建立起复杂的映射关系。”

　　联合科研团队进而首次绘制出与棉花纤维发育相关、独立于遗传因素的表观调控网络，揭示了43个潜在参与纤维发育的eQTM基因。其中一个位点已通过基因编辑实验，证实其调控棉花纤维长度的作用。

　　浙江大学棉花精准育种团队方磊教授表示：“这项研究成果证明了DNA甲基化数据可作为育种资源，为棉花品种改良提供新的思路。依托生命科学+AI，育种家们将持续挖掘关键基因、预测农艺性状，加速培育‘超级’作物。”