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在南通基金开户，选择哪家券商需要考虑多个因素，包括但不限于：

佣金费率：不同券商的佣金费率有所差异，你需要选择一家佣金费率相对较低的券商。
平台和服务：券商的平台、交易软件以及客户服务的质量也是需要考虑的因素。你需要选择一家平台稳定、交易软件易于使用且客户服务优良的券商。
资质和信誉：券商的资质和信誉也非常重要，你需要选择一家有良好信誉和稳定资质的券商。

基于以上因素，以下是一些可能适合南通基金开户的券商：

中信证券：中信证券是国内领先的证券公司之一，其综合实力强，服务优良，且拥有稳定的交易平台和良好的信誉。
华泰证券：华泰证券是一家大型证券公司，其交易软件易用性较强，客户服务较好，同时佣金费率也相对较低。
国金证券：国金证券是一家综合性较强的证券公司，其平台稳定、交易安全，且拥有良好的客户服务。
国泰君安：国泰君安是一家历史悠久的证券公司，其综合实力强，服务优良，且在南通地区有良好的业务基础。

请注意，以上排名仅为参考，并无先后之分。在选择券商时，建议投资者多方面比较和考虑，选择最适合自己的券商进行开户和投资。