花生因为后熟作用，能够放出较多的水汽和热量，从而导致霉变、浸油、发热和酸败。同时花生还很容易受到黄曲霉素的影响，黄曲霉毒素是一类天然存在的致癌物，毒性极强。如果花生被黄曲霉毒素污染，则会带有毒性，不再适合食用。另外花生果由于富含油脂与蛋白质的特点，在高水分的环境下，加上自身较强的新陈代谢，非常容易变性，特别是在夏季高温、高湿的环境下，容易被霉菌污染，同时病虫在花生果上也繁殖旺盛，从而导致极大的损耗，因此不适合长距离的运输。

花生的品种、花生的含水量、以及花生壳上携带的病菌，还有温度、湿度、通风等环境因素都会影响花生的储藏。通常情况下，花生果比花生仁更容易储藏，但花生果的仓容要求较高，是同等情况下花生仁仓容的2.5倍。

花生贮藏可以采用室内装袋垛存法、室外囤存法、室内散装堆放法、低温冷库贮藏法和熏蒸贮藏法这样五种方法，目前在我国主要采用的是室内装袋垛存法。对于室内装袋垛存法，需要注意的点是垛的体积不能过大，过大将会影响花生的通风情况、日常检查和管理，以及最后的发货运输。如果选择在室外直接囤存，则建囤的地方最好要干燥、向阳和通风。当花生装满囤后，需要使用草苫把囤封住，囤的外形呈圆锥形，半径一般以0.5到1m为宜，太大了或者太小了都不好。一般一个囤能够贮藏花生果1000到1500kg。如在平房顶上建囤，囤的高度一般选择1.33米， 半径0.83m左右，这样贮藏的话利于通风、减少鼠害、降低成本。第三种方法是室内散装堆放法，这种方法存在的问题是容易造成通气不良，热量无法有效散发出去，不便于进行管理，花生果还容易受潮及遭到病虫害。第四种方法是低温冷库贮藏法。在5到10℃的低温冷库进行贮藏，花生的贮藏效果将会大大提高，这种方法最主要的问题就在于低温冷库的建设、维持运转成本巨大，普通单位和企业很难承受这种负担。最后一种方法是熏蒸贮藏法，目前最多采用的是利用化学制剂先将花生果进行熏蒸，然后再进行贮藏，这种方法最大的缺点就是操作过程复杂，会影响周围环境和人的身体健康。所以现在市面上出现了利用香辛料精油包来进行熏蒸，更加的安全、方便、健康和环保，使用起来效果也挺好。

对于花生果的贮藏来说，需要注意晾晒及干燥这两个步骤，因为花生果刚收获的时候它的含水量达到了50%到60%，含水量很高，所以收获后要及时将花生进行晾晒，使其充分晒干，防止发生霉变以及腐烂，在我国的花生主产区，特别是北方地区，一般农民收获后将花生果直接在放在田间进行晾晒，还有一种方法是将花生果放在专门的晾场进行晾晒。晾晒完毕之后就需要进行干燥了，花生果干燥的方法主要有两种，自然干燥法和机械化催干法，自然干燥法的因其成本很低，所以我国目前主要采用的是自然干燥法。机械化催干法是指在大型容器中通入加热（或不加热） 的空气，通过调节花生果的堆层厚度、空气温度与湿度、还有通风量等条件来控制干燥过程，从而保证花生具有良好的品质。据试验，当花生果的水份低于9%时具有长期贮藏的条件。在冬季当花生果处于15%的空气湿度环境下，可以直接在小露天囤贮存，次年晚春的时候再把花生果转入仓内保管。

对于花生仁的贮藏来说，需要注意干燥、低温和密闭三点，因为剥壳后花生仁的含水量会达到20%左右，然而安全贮藏水分含量要求低于10%。干燥指的是先将花生果干燥后再脱壳，令花生仁的水份保持10%以下，便于长期贮藏。低温指的是低于20℃，因为花生仁在水分低于10%，温度20℃以下的环境下，能够长期贮存。如果温度升高，花生仁就容易产异味，发生变质。密闭指的是在3月份的时候，气温达到5℃以下时，开始密闭（压盖或套囤均可），来防止病虫虫霉菌感染以及外界温湿度变化的影响，确保花生仁贮藏安全。

花生的应用有三种，一种是食用，一种是油用，最后一种是压榨后成为花生粕，作为饲料及工业用。花生的食用有两种，一种是直接食用，我国对于花生的食用方法有直接生食，或者将花生进行简单的处理，如油炸花生、煮花生、烤花生之后再食用，还可以将花生加工成糕点类食品、糖果类食品、小吃类食品、西式类食品等等。另外一种方式是进行深加工，使其成为深加工食品。深加工食品方面，我国花生深加工制品主要有花生酱、花生饮品及花生蛋白等。花生酱大部分用于出口，不过目前其在国内的市场份额也有所扩大，受到了越来越多人的喜欢。花生饮品由于没有豆浆那种豆腥味，受到了广大消费者的欢迎。花生蛋白产品种类多样，其中最主要的产品为粉状花生蛋白，比如分离蛋白、花生粉、浓缩蛋白等。

在做食用油用方面，按照传统，花生主要用作榨油。油用花生量约占花生产量的53%，目前我国是全球最大的花生油生产国与消费国。花生、大豆、菜籽、葵花是我国主要的油料作物，这其中花生出油率在40%左右，葵花出油率在38%左右，菜籽出油率在36%到38%左右，国产大豆出油率17.5%左右，花生的出油率最高。目前从花生中获得花生油的方法主要有压榨法、水剂法、水酶法以及溶剂浸出法。

在作为饲料及工业用方面，将花生进行榨油后剩下的副产品主要有花生壳以及花生粕。花生粕含有50%以上的蛋白质，主要的用途是拿来做饲料或者肥料，也可以加工成食用粉。花生壳的的用途广泛，可以拿来作饲料，因为具有真菌营养所需的纤维素和木质素,可以用于栽培食用菌。在工业上可以用于制造活性炭、胶粘剂、碎料板等。在医学上因为花生壳的内涵物具有降血压、降血脂等功效，所以还可以用于制药。