您好，主要是两个区别，一个是代码上的区别：
深圳债券逆回购的代码为1318开头的代码。
1天逆回购代码为131810，
2天逆回购代码为131811，
3天逆回购代码为131800，
4天逆回购代码为131809，
7天逆回购代码为131801，
更多逆回购代码可通过股票软件查询在线行情。
上海国债逆回购的代码为2040开头的代码。
1天逆回购代码为204001，
2天逆回购代码为204002，
3天逆回购代码为204003，
第二，就是参与门槛不一样，深圳的逆回购是1000元起，上海的是10万元起。所以一般上海的国债逆回购收益略高于深圳同期的逆回购。
除此之外，暂时没有其他的区别，都是在手机上操作的。
投资需谨慎，有任何不明白的问题，可以与我沟通。