一、基金目标不同：主动型基金追求的是跑赢大盘，跑赢业绩基准，做到同类基金排名靠前就行了。一只优秀的主动型基金，不仅牛市赚的比别的基金多，熊市跌的也比别的基金少。指数基金的目标是跟进指数，争取同步，减少跟踪误差。靠指数基金赚钱，最重要的是选对指数，其次才是选择跟踪误差小、基金手续费低的指数基金。
二、操作方式不同：主动型基金中，基金经理可以根据形势，主动增仓建仓，尤其是混合型基金最为灵活。而指数基金则不能动，只能跟着指数同步。所以在牛市中，指数基金仓位高，涨的最多；在熊市中，指数基金也是因为仓位高，跌的最狠。相比指数基金，指数增强基金给了基金经理一定的操作空间，灵活性比指数基金更好。
三、买卖费用不同：主动型基金由于管理难度更高，买卖费用也比指数基金高，具体费用要看基金本身和购买渠道。