如果您的自然科学基金项目涉及原单位不配合转出，且被项目主管部门（如国家自然科学基金委员会）暂停或者终止，可能会产生以下影响：

1. 项目进度受阻：原单位不配合转出可能导致项目团队成员无法顺利开展工作，从而影响项目进度。

2. 资金冻结或收回：如果原单位不配合转出，可能会导致项目资金被冻结，影响项目的资金使用。此外，主管部门可能会要求回收未使用的资金，给项目带来经济损失。

3. 项目成果受损：由于项目进度受阻和资金受限，可能导致项目最终无法达到预期的研究目标，进而影响项目的整体成果。

4. 信誉受损：如果因为原单位不配合转出而导致项目被暂停或终止，项目负责人和团队成员的信誉可能会受到影响，对未来申请其他项目或获得科研资源产生不利影响。

5. 法律责任：如果原单位不配合转出的行为违反了相关法律法规，项目负责人和团队成员可能需要承担一定的法律责任。

为了避免这些影响，建议您尽快与原单位沟通，寻求解决方案。如果沟通无果，您可以向项目主管部门反映情况，寻求支持和帮助。同时，确保遵守相关法律法规和项目规定，确保项目顺利开展。

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