而新三板是原中关村科技园区非上市股份有限公司进入代办股份系统进行转让试点，因挂牌企业均为高科技企业而不同于原转让系统内的退市企业及原STAQ、NET系统挂牌公司。两者之间，A股企业挂牌上市需要符合国家的相关规定，新三板企业挂牌难度低，大多数企业都符合要求。而且，A股投资门槛低，目前国内散户仍然占据主体地位，机构投资者队伍在不断壮大。但新三板投资门槛高，多为专业的机构投资者。并且，新三板可以采取协议方式、做市方式、竞价方式或其他中国证监会批准的转让方式。而主板、中小板、创业板采用竞价交易方式，A股的大宗交易是采用协议大宗交易和盘后定价大宗交易方式。