1、投资者准入门槛：投资者想要进入创业板交易，必须要有10万元资金以及2年的证券交易经验；而科创板则需要50万元及2年证券交易经验。科创板的资金门槛较高是因为中科创板上市的公司风险高，必须具备一定资金实力和交易经验的投资者才能参与，这样可以有效保护一些喜欢跟风操作且没有经验的投资者。
2、服务定位：创业板深入贯彻创新驱动发展战略，主要是服务于成长型的创业企业，支持传统产业与“新”深度结合。而科创板的定位则是服务于符合国家战略，市场认可度高的科技创新企业。
3、股票交易规则：创业板市价委托支持设置保护限价，有涨跌幅、无涨跌幅适用于市价委托；而科创板无保护限价设置，无涨跌幅限制证券不支持市价委托。创业板委托股数200股起报，1股递增；科创板100股整数倍。